-
1 метод обрыва цепи
[греч. methodos — способ познания]метод, применяемый при определении нуклеотидной последовательности ДНК (см. секвенирование ДНК), который основан на полимеразной цепной реакции (см. полимеразная цепная реакция). В качестве матрицы в этой реакции используется одноцепочечная ДНК, нуклеотидную последовательность которой надо определить. Первоначально матрицу гибридизуют с коротким праймером, связывающимся с ее 3'-концом. Затем в реакционную смесь добавляют четыре дезоксирибонуклеозидтрифосфата (дНТФ) и один из четырех дидезоксирибонуклеозидтрифосфатов (ддНТФ). Остановка синтеза новой цепи ДНК-полимеразой (обрыв цепи) будет происходить всякий раз, когда вместо дНТФ в растущую цепь ДНК будет встраиваться соответствующий ему ддНТФ. Для определения последовательности нуклеотидов необходимо осуществить четыре отдельные реакции в присутствии каждого из четырех ддНТФ. Затем четыре пробы вносят в соседние лунки пластины геля и проводят гель-электрофорез, в котором длина пробега каждого компонента обратно пропорциональна длине цепи. Как только фрагменты ДНК визуализированы, нуклеотидную последовательность можно прочесть прямо в геле снизу по направлению к старту в соответствии с очередностью, в которой фрагменты располагаются на отдельных "дорожках". М.о.ц. предложен Ф. Сенгером в 1975 г. (Нобелевская премия за 1980 г. совместно с У. Гилбертом и П. Бергом).Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский. > метод обрыва цепи
-
2 метод
Метод структурного анализа олигонуклеотидов, основанный на том факте, что при добавлении нового нуклеотида к растущей точке транскрипта alpha-фосфат на его 5'-гидроксиле связывается с 3'-гидроксилом предшествующего нуклеотида.
Метод генетической инженерии, основанный на присоединении к 3'-концам цепей, образующих двухцепочечную ДНК, коротких отрезков одноцепочечной ДНК с регулярной последовательностью ( гомополимерных). Ксли каждый подобный гомополимер состоит из нуклеотидов одного вида и если два таких гомополимера с взаимно комплементарными основаниями присоединены соответственно к плазмиде и кольцевой ДНК, то последние, оказавшись рядом, замкнутся друг на друга с образованием рекомбинантной плазмиды.
Метод определения чувствительности микроорганизма к антимикробному лекарственному средству, нанесенному на бумажный диск или ( в виде раствора) в лунку, вырезанную в агаре, основан на измерении зоны ингибирования роста.
Приготовление срезов препарата в замороженном состоянии.
Использование меченых соединений, связанных со специфическими антителами, для локализации антигена (например, белка) в клетке.
Аналитическая процедура, используемая для определения количества азота в образце.
Наиболее широко используемый метод количественного биохимического анализа белков.
Метод, используемый для выделения определённого типа микроорганизмов из смешанной культуры. Для этого состав среды, pH, температура, освещённость, питательные кофакторы и т. п. подбираются таким образом, чтобы способствовать наиболее быстрому росту требуемого организма и, наоборот, замедлять рост нежелательных видов.
Метод, используемый для определения нуклеотидной последовательности ДНК (см. также секвенирование).
метод перепечатывания колоний — replica plating (см. также перепечатывание)
Один из методов определения нуклеотидной последовательности ДНК, основанный на синтезе комплементарных цепей ДНК.
Регулирование процесса непрерывного культивирования микроорганизмов изменением pH среды.
Метод определения концентрации бактериальных взвесей, основанный на оценке степени мутности.
Метод, используемый для определения нуклеотидной последовательности ДНК (см. также секвенирование).
-
3 chain termination method
Англо-русский словарь по биотехнологиям > chain termination method
-
4 нуклеозида аналог
синтетическое соединение, которое соответствует одному из природных нуклеозидов, но при этом модифицировано так, что не способно принимать участие в синтезе нуклеиновой кислоты; напр., дидезоксирибонуклеозидтрифосфат, который используется для терминации синтеза ДНК при ее секвенировании (см. метод обрыва цепи).Толковый биотехнологический словарь. Русско-английский. > нуклеозида аналог
-
5 секвенирование
Определение последовательности аминокислотных остатков в белках и последовательности нуклеотидов в нуклеиновых кислотах.
секвенирование белка — protein sequencing (см. также белки)
секвенирование ДНК — DNA sequencing (см. также ДНК)
Метод определения нуклеотидной последовательности, основанный на синтезе радиоактивно меченой комплементарной цепи ДНК с использованием в качестве матрицы нативной ДНК. В реакционной смеси присутствуют четыре немеченых дезоксирибонуклеозидфосфата, из которых строится комплементарная цепь ДНК, и модифицированная форма одного из оснований, при включении которого рост цепи прекращается. В результате синтезируются цепочки ДНК различной длины. Цепи разделяют с помощью гель-электрофореза и проводят радиоавтографию. Последовательность оснований считывают непосредственно с фотоплёнки.
секвенирование ДНК методом химического расщепления по Максаму и Гилберту — Maxam-Gilbert chemical sequencing cleavage
Метод определения нуклеотидной последовательности, при котором метят 3'-конец молекулы ДНК радиоактивным фосфатом (32PO43–). Затем ДНК обрабатывают реагентами, расщепляющими эту цепь около определённых оснований. С помощью электрофореза в полиакриламидном геле разделяют фрагменты разной длины. Последовательность оснований считывают с плёнки, полученной методом радиоавтографии.
секвенирование РНК — RNA sequencing (см. также РНК)
Метод определения последовательности оснований в самой РНК, для чего сначала метят 5'- конец или 3'-конец молекулы РНК с помощью 32PO43–. Затем меченую цепь расщепляют с помощью ферментов, специфичных к определённым последовательностям. Используя радиографию, получают карту, по которой находят последовательность оснований.
Метод определения последовательности оснований, в котором вначале синтезируют цепочку ДНК, комплементарную РНК, а затем определяют её нуклеотидную последовательность. Далее с помощью метода химического расщепления для секвенирования ДНК получают радиоавтограмму.
Русско-английский словарь терминов по микробиологии > секвенирование
См. также в других словарях:
Метод обрыва цепи метод Сэнгера — Метод обрыва цепи, метод Сэнгера * метад абрыву ланцуга, м. Сэнгера * chain termination method or ch. t. v. of Sanger метод, используемый для определения нуклеотидной последовательности ДНК () … Генетика. Энциклопедический словарь
Метод Сэнгера — «Секвенирующая лестница», радиоавтограф геля Метод Сэнгера метод секвенирования (определения последовательности нуклеотидов) ДНК, также известен как метод обрыва цепи. Впервые этот метод секвенирования был предложен Фредериком Сэнгером в 1977… … Википедия
МОНТЕ-КАРЛО МЕТОД — метод статистических испытаний, численный метод, основанный на моделировании случайных величин и построении статистич. оценок для искомых величин. Принято считать, что М. К. м. возник в 1949 (см. [1]), когда в связи с работами по созданию атомных … Математическая энциклопедия
Секвенирование по Сэнгеру — Метод Сэнгера метод секвенирования (определения первичной последовательности нуклеотидов молекулы нуклеиновых кислот) ДНК и РНК. Метод Сэнгера также известен как метод обрыва цепи. Метод основан на присоединении к однонитчатой секвенируемой… … Википедия
Секвенирование — биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от лат. sequentum последовательность). В результате секвенирования получают формальное описание… … Википедия
Секвинирование — Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их первичной аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от англ. sequence последовательность). В результате получается линейное символьное описание,… … Википедия
Секвенирование ДНК — Секвенирование биополимеров (белков и нуклеиновых кислот ДНК и РНК) определение их первичной аминокислотной или нуклеотидной последовательности (от англ. sequence последовательность). В результате получается линейное символьное описание,… … Википедия
ЦЕПНЫЕ РЕАКЦИИ — хим. превращения и ядерные процессы, в к рых появление промежуточной активной частицы (свободного радикала, атома, возбужденной молекулы в хим. превращениях, нейтрона в ядерных процессах) вызывает цепь превращений исходных в в. Примеры хим. Ц. р … Химическая энциклопедия
Цепные реакции — химические и ядерные реакции, в которых появление промежуточной активной частицы (свободного радикала, атома или возбуждённой молекулы в химических, нейтрона в ядерных процессах) вызывает большое число (цепь) превращений исходных молекул… … Большая советская энциклопедия
ПОЛИМЕРИЗАЦИЯ — (от греч. polymeres состоящий из многих частей), процесс получения высокомолекулярных соединений, при к ром молекула полимера (макромолекула )образуется путем последоват. присоединения молекул низ комол. в ва ( мономера )к активному центру,… … Химическая энциклопедия
КИНЕТИКА ХИМИЧЕСКАЯ — (от греч. kinetikos движущий), раздел физ. химии, изучающий хим. р цию как процесс, протекающий во времени, механизм этого процесса, его зависимость от условий осуществления. К. х. устанавливает временные закономерности протекания хим. р ций,… … Химическая энциклопедия
